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办理保密资质认证的步骤：咨询备案、受理登记;根据具体情况，省科工办到申请保密资格单位了解;省市作具体指导;成立保密委员会、保密办公室、定密小组，按规定划分保密要害部门部位及涉密人员;对涉密人员进行审查。
军工保密资格认定如何实施？
根据“意见”要求，国家保密局、原国防科学技术工业委员会、原总装备部制定了《武器装备科研生产单位保密资格审查认证管理办法》（国保发［2002］4号）及一级、二级、三级《武器装备科研生产单位保密资格标准》和《武器装备科研生产单位保密资格评分标准》。随着军民融合发展提升为国家战略的实施，大批非公有制企业进入军工领域，参与武器装备科研生产活动。为切实加强保密依法行政，于2014年将武器装备科研生产单位保密资格认证，由非行政许可涉密审批事项确定为国家保密行政管理部门行政许可事项，名称修改为“武器装备科研生产单位保密资格认定”。
哪些企业不能申报保密资质？
1.有境外（含港澳台）控股或直接投资的公司不能申请军工保密资质；
2.通过间接方式投资的外方投资者及其一致行动人的出资比例超过20%的公司不能办理军工保密资质；
3.法定代表人、主要负责人、实际控制人、董（监）事会人员、高级管理人员以及承担或者拟承担涉密武器装备科研生产任务的人员必须为中华人民共和国国籍，无境外居留权或者长期居住许可，与境外（含港澳台）人员无婚姻关系，否则不能申请军工保密资质；
4.没有承担或者拟承担涉及国家秘密的武器装备科研生产项目、产品的企业不能办理军工保密资质；
5.成立时间不到三年的企业，不能申请军工保密资质；
6.代理公司或经销商且不具备生产研发能力的企业不能申请军工保密资质。
现场审查结果说明？
现场审查结果分为“通过”、“不通过”或者“中止”。依据相应等级的保密资格标准及评分标准，满分为500分，达到450分(含)以上为现场审查通过，450分(不含)以下为现场审查不通过。审查中发现申请单位达不到《评分标准》所列基本项要求的，中止审查。未通过现场审查的单位，6个月内不受理再次申请。现场审查中止的，3个月内不重新进行现场审查。